Olá, você fez bem em cuidar do físico antes de buscar alguma explicação no não-físico. Eu ia perguntar se vc não tem pressão alta e tal, mas vc já disse que já foi em vários médicos e que está tudo certo com o organismo. O local que você sente essas pulsações podem coincidir sim com o local de chakras, que são centros de energia. Se te incomodam, eles podem estar "desalinhados", "sobrecarregados" ou "fechados". O ideal seria você mesmo poder cuidar desses chakras. O primeiro passo é o conhecimento deles, vc pode começar com esse excelente vídeo:
Você pode fazer uma técnica energética, deitado antes de dormir, mentalizar uma luz branda no topo da cabeça, que seria o chakra coronário, e mentalizar que essa luz está ao mesmo tempo brilhando nesse chakra e tranquilizando, acalmando, relaxando músculos e energias, trazendo uma sensação de paz. E repetir a passagem dessa luz em cada um dos chakras, principalmente dos chakras que coincidem com as partes do corpo que te incomodam. Abraço!